Główna ekspozycja znajdująca się na parterze zawiera fragment wiatraka odwadniającego z przełomu XVIII i XIX wieku, pochodzącego z Grochowa III (dawniej Neukrügerskampe). W czasach Wolnego Miasta Gdańska został on przeniesiony do skansenu techniki w Oliwie. W latach 50-tych i 70-tych uległ częściowemu spaleniu, po czym zdecydowano o przeniesieniu pozostałości wiatraka do miejscowości Wieniec na Wyspie Sobieszewskiej, gdzie niestety ulegał dalszej degradacji. W 2005 roku dzięki staraniom członków Klubu Nowodworskiego i za zgodą konserwatora zabytków Miasta Gdańska, resztki wiatraka zostały przeniesione i wyeksponowane w Muzeum Żuławskim, stanowiąc najcenniejszy eksponat żuławski.
Dalszą częścią wystawy związanej z ochroną przeciwpowodziową jest Magazynek Strażnika. Powstał on z inspiracji holenderskim skansenem, w którym została odtworzona strażnica przeciwpowodziowa. Nasza ekspozycja przedstawia dawny magazyn strażnika wałowego. Zgromadziliśmy unikatowe wyposażenie, które stanowi tło do prezentacji również współczesnych metod ochrony przeciwpowodziowej – nowoczesne napełniacze worków z piaskiem i wzór prawidłowo ułożonego wału przeciwpowodziowego. To wszystko stanowi doskonałe narzędzie dla edukacji przeciwpowodziowej. Z tematem wody związana jest również wystawa “Nowy początek 1945” poświęcona osadnikom, którzy przybyli na zatopione i zrujnowane Żuławy po II wojnie światowej i wykonali tytaniczną pracę aby je odwodnić i przywrócić do życia.
Zwieńczeniem ekspozycji żuławskiej jest makieta kolei wąskotorowej we wsi Lichnówki.
W części dotyczącej Stolicy Żuław prezentujemy wystawę poświęconą historii miasta oraz makietę przedwojennego Nowego Dworu Gdańskiego. Na nowodworskiej wystawie znajdziemy m.in. kącik o gorzelni i browarze rodziny Stobbe – butelki, transportery, beczki, kieliszki oraz fragment komina z fabryki. Ciekawym eksponatem jest koło młyńskie z największego młyna na Żuławach, którego właścicielem był Otto Schlenger z przedwojennego Tiegenhofu.
Podczas zwiedzania można obejrzeć film “Duchy Miasta”, wykonany z okazji 450 lecia Nowego Dworu Gdańskiego.