W piwnicy znajduje się rekonstrukcja średniowiecznej pracowni alchemicznej. Choć alchemia najczęściej obecnie kojarzona jest z magią, przemianą metali nieszlachetnych w złoto, poszukiwaniem kamienia filozoficznego i eliksiru wiecznej młodości, należy pamiętać, że była to dziedzina wiedzy wykładanej na średniowiecznych uniwersytetach. taki był wówczas standard racjonalności. Arabskie słowo al-kimya’ oznaczało to, co dziś rozumiemy pod pojęciem chemii. Chęć wyróżnienia i opisania składowych części, z których zbudowany jest świat, sprawiła, że alchemicy przyczynili się do rozwoju wiedzy. Opracowali sposoby wytwarzania tuszu, barwników, farb, kosmetyków, ceramiki i prochu strzelniczego. Ponadto przyczynili się do poznania procesów obróbki rud metali, destylacji, garbowania skór, produkcji szkła, przygotowania ekstraktów i nalewek.
Jako że alchemicy starali się poznać elementy, z których zbudowana jest rzeczywistość, tworzyli pierwsze tablice okresowe. Alchemia miała istotny wpływ na farmację, co potwierdza m.in. fakt, że lekarze (fizycy) i aptekarze używali niekiedy tych samych co alchemicy symboli dla oznaczania składników w recepturach, czynności chemicznych, naczyń aptecznych. Przyczynili się też do rozpowszechnienia chemii ogólnej i farmaceutycznej. Udoskonalili bowiem metody oczyszczania ciał przez zastosowanie procesów takich jak destylacja, sublimacja i krystalizacja. W swoich doświadczeniach posługiwali się aparatami, które do dziś stosowane są w laboratoriach chemicznych, np. łaźniami wodnymi, kolbami destylacyjnymi, chłodnicami i odbieralnikami.