W salach dawnych koszar przygotowano wystawę, która za pomocą plansz, makiet, dioram i urządzeń multimedialnych przybliża zwiedzającym wielowiekową historię fortyfikacji Torunia oraz wszelkie aspekty z nią związane. Ekspozycję uzupełniają cenne eksponaty m.in. przewoźna wieża pancerna czy też broń będąca na wyposażeniu żołnierzy broniących miasta. W salach ekspozycyjnych można zapoznać się z poszczególnymi etapami powstawania i funkcjonowania Twierdzy Toruń, od średniowiecza, poprzez czasy nowożytne, wiek XIX aż do końca II wojny światowej.
Tematyka poszczególnych bloków prezentowana jest w sposób chronologiczny, pozwalający na ukazanie ewolucji fortów toruńskich na przestrzeni dziejów sztuki fortyfikacyjnej. W każdej sali wystawowej (komorze koszar) przedstawiono jedno zagadnienie.
Ogólny scenariusz wystawy prezentuje tematykę:
rozwój przestrzenny fortyfikacji (ich rdzenia i zewnętrznego pasa umocnień) dzieje Torunia, gdy był on miastem przygranicznym wpływ twierdzy na miasto pruskie koncepcje fortyfikowania Torunia garnizon twierdzy i jego wpływ na życie miasta codzienność twierdzy wybitnych dowódców sprzętu związanego z twierdząhistorię hal balonowych i lotnictwa